خانقاه یکی از روستاهای استان آذربایجان شرقی است که در دهستان قرهناز بخش مرکزی شهرستان مراغه واقع شدهاست. و براساس سرشماری مرکز آمار ایران در سال 1390،جمعیت آن 723 نفر ودارای 212خانوار بودهاست.
روستای خانقاه در 7 کیلومتری جنوب غربی مراغه قرار دارد از آثار تاریخی آن می توان به پل خانقاه مربوط به دوره صفویه اشاره کرد.
مختصات جغرافیای روستا
طول جغرافیایی 93 درجه 03 دقیقه و 23 ثانیه شمالی و 64 درجه 06 دقیقه 46 ثانیه شرقی قرار گرفته است. روستای خانقاه یکی ازنادرترین روستاهای شهرستان مراغه می باشد که ابنیه تاریخی آن امروزه قابل مشاهده است. پل تاریخی این روستا یکی از زیباترین پلهای تاریخی شهرستان مراغه است ولی متاسفانه به دلیل بی توجهی وضعیت چندان خوبی بر خوردار نیست. شغل اکثر مردم روستاکشاورزی آنهم بیشتر کشت انگور است هر چند باغات گردو و سیب نیز قابل مشاهده است ولی اکثریت به شغل انگور داری مشغول هستند. این روستا همچنین دارای زمین های کشاورزی مخصوص سبزی(سئوزو خانا)است.